プロテインファクトリー部門

活動内容

プロテオーム解析によって、有効なバイオマーカーを発見し、診断薬・治療薬開発のスピードアップに貢献するためには、多種多様なサンプルの大規模解析を行っています。

当プロジェクトの特徴は、同一組織等サンプルからRNA、続いてDNAを抽出し、さらにタンパク質を調製している点です。これら3分子の動態（ゲノム・遺伝子発現・プロテオーム）を直接比較できるようにし、疾患のより詳細な解析を行っております。

プロテオーム解析のために、福島県立医科大学付属病院等からの疾患患者由来組織サンプルやモデル動物由来サンプル、様々な処理を施した細胞由来サンプルに加え、市販の組織サンプル等も購入し、これらのサンプルからのタンパク質精製法と長期保存法を確立しました。

疾患患者由来組織サンプル等のプロテオーム解析においては、1組織由来のサンプル中に存在するタンパク質をできる限り網羅的に解析する方法と、多数組織のサンプル中に存在するターゲットタンパク質を1回の解析で検出する方法との2種類の大規模解析法が存在します。

主に開発が進められているのは前者ですが、大規模に集積されるタンパク質サンプルを短時間で、かつ網羅的に解析するに十分な方法は未だ開発されていません。

そこで当部門では、後者のプロテオーム解析技術である逆相タンパク質マイクロアレイ解析法（RPPMA）の開発に取り組んでいます。本研究開発により、数千の組織等由来のタンパク質を1枚のスライドガラスにプリントできるようになりました（目標：3万サンプル）。

このタンパク質アレイを使用することにより、様々な疾患患者由来組織（症例）に発現している疾患関連タンパク質等を短時間で検出・比較することが可能になりました。

今後は、プリントサンプル数の増加と検出条件の最適化を進め、さらに、RPPMAで発見したターゲットタンパク質の詳細解析を質量分析法（MS）および２次元電気泳動（2DE）法で行うことで、翻訳後修飾等の詳細な情報を付加することを目指しております。

スタッフ